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/ Aminet 6 / Aminet 6 - June 1995.iso / Aminet / misc / sci / prosite.lha / Prosite / data / PDOC00484 < prev    next >
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Text File  |  1995-03-04  |  1.9 KB  |  36 lines
  1. ******************************************************
  2. * Eukaryotic molybdopterin oxidoreductases signature *
  3. ******************************************************
  4.  
  5. A number of   different  eukaryotic  oxidoreductases  that require  and bind a
  6. molybdopterin cofactor have  been shown [1] to share a few regions of sequence
  7. similarity. These enzymes are:
  8.  
  9.  - Xanthine dehydrogenase (EC 1.1.1.204),  which catalyzes  the   oxidation of
  10.    xanthine to uric acid with  the concomitant reduction of NAD. Structurally,
  11.    this enzyme  of about 1300 amino acids consists of at least three  distinct
  12.    domains: an   N-terminal  2Fe-2S  iron-sulfur  binding  domain,  a  central
  13.    FAD/NAD-binding domain and a C-terminal Mo-pterin domain.
  14.  - Nitrate reductase (EC 1.6.6.1), which  catalyzes  the  reduction of nitrate
  15.    to nitrite.  Structurally, this enzyme of about 900 amino acids consists of
  16.    an N-terminal Mo-pterin domain,  a central cytochrome b5-type  heme-binding
  17.    domain and a C-terminal FAD/NAD-binding cytochrome reductase domain.
  18.  - Sulfite oxidase (EC 1.8.3.1), which  catalyzes  the oxidation of sulfite to
  19.    sulfate. Structurally, this enzyme of about 460 amino acids  consists of an
  20.    N-terminal cytochrome b5-binding domain followed by a Mo-pterin domain.
  21.  
  22. There are a few conserved regions in the sequence of the molybdopterin-binding
  23. domain of  these enzymes. The pattern we use to detect these proteins is based
  24. on one  of  them.  It  contains  a cysteine residue which could be involved in
  25. binding the molybdoterin cofactor.
  26.  
  27. -Consensus pattern: [GA]-x(3)-[KRNQH]-x(11,14)-[LIVMFYWS]-x(8)-[LIVM]-x-C-
  28.                     x(2)-[DEN]-R-x(2)-[DE]
  29. -Sequences known to belong to this class detected by the pattern: ALL.
  30. -Other sequence(s) detected in SWISS-PROT: 3.
  31. -Last update: June 1994 / Pattern and text revised.
  32.  
  33. [ 1] Wooton J.C., Nicolson R.E., Cock J.M., Walters D.E., Burke J.F.,
  34.      Doyle W.A., Bray R.C.
  35.      Biochim. Biophys. Acta 1057:157-185(1991).
  36.